Page 22 - BİOMEDYA SAYI 37

22 BİYOTEKNOLOJİ VE YAŞAM BİLİMLERİ GAZETESİ MART - NİSAN 2022 www.biomedya.com

MIKROSKOBIK

SAATLI BOMBALAR

Bazı bağırsak bakterilerinin ürkütücü bir süper gücü
var: Diğer mikropların içinde gizlenen uyku halindeki
virüsleri yeniden canlandırabiliyorlar.

Bağırsak bakterileri her türlü kimyasalı Breck Duerkop, "Kimyasal özellikleri kolibaktinin yapısını bir araya ve virüs içeren birçok bakterinin
üretirler, ancak çoğunun tam hakkında çok şey biliyoruz, onları getirdiler ve çift sarmal içinde hatalı büyümesinde düşüşler gözlemlediler.
anlamıyla ne yaptıklarını bilmiyoruz. laboratuvarda saflaştırıyoruz ve bağlantılar oluşturarak DNA'ya zarar Dolayısıyla bu durumun molekülde
Yeni bir çalışma, daha önce kanserle antibiyotikler de dahil olmak üzere verdiğini belirlediler. bulunan aktif ve hücre öldürücü
bağlantılı olan böyle bir bileşiğin, ilaç olarak kullanıyoruz" diyor. enfeksiyonlarında bir artışa neden
mikrobiyal çatışmalarda tuhaf bir silah Bu çalışmadan yola çıkarak, başka olduğunu ileri sürdü. Kolibaktin
görevi görebileceğini öne sürüyor. Ancak bu araştırmaya dahil yerlerdeki bilim insanları kanserle aslında bakterilere giriyor ve DNA'ya
olmayan Duerkop, bakterilerin bu kesin bir bağlantı ortaya çıkardılar: zarar veriyor. Bu hasar, virüsleri
Howard Hughes Tıp Enstitüsü bileşikleri neden ürettiğini ve komşu Molekülün ayırt edici parmak harekete geçiren hücresel bir uyanış
Araştırmacısı Emily Balskus'un organizmalar üzerindeki etkilerinin izleri, kolorektal tümör büyümesini zili çalıyor.
laboratuvarı ilk olarak bioRxiv.org'da açık uçlu sorular olduğunu söylüyor. yönlendirdiği bilinen genlerde
ve daha sonra Nature dergisinde 23 Balskus'un ekibinin yeni çalışmasını görünüyor. Pek çok mikrop, kendilerini kolibaktine
Şubat 2022'de bir ön baskı olarak da "doğru yönde bir adım" olarak karşı korumak için donatılmış
yayınlandı. Kolibaktin adı verilen nitelendiriyor. VIRÜSLER IÇIN BIR ROL görünüyordu. Balskus'un laboratuvarı,
şifreli bir molekülün ölümcül virüsleri çok çeşitli bakterilerde bileşiği
uyandırabileceği bulundu. KIMYASAL KARANLIK MADDE Balskus'un en son kolibaktin çalışması nötralize eden bir proteini kodlayan
başka bir hastalıkla başladı: COVID-19. bir direnç geni tanımladı.
Mikroplar genellikle bağırsağın dar Bilim insanları, yıllardır kolibaktinin Diğer birçok laboratuvar gibi, onunki
bölgelerinde birbirlerine saldırmak insan hücrelerinde hasara yol de araştırmacılar arasındaki fiziksel Balskus, kolibaktin'in açıkça tehlikeli
için zararlı bileşikler üretirler, ancak açabileceğini biliyorlardı. Balskus teması azaltmak için işleri yeniden bir yanı olmasına rağmen, ölümcül bir
Balskus, “Bu kimyasal silahlar ve başkaları tarafından yapılan düzenlemek zorunda kaldı. Görev silahtan daha fazlası olarak hizmet
arasında kolibaktin alışılmadık araştırmalar, bileşiğin DNA'ya zarar değişikliğinin bir parçası olarak, edebileceğini söylüyor. Örneğin
görünüyor. Normalde mikrobiyal vererek kolorektal kansere yol doktora sonrası Justin Silpe ve hem DNA hasarı hem de uyanmış
topluluklar içinde bakteriyel açabileceğini göstermiştir. Ancak yüksek lisans öğrencisi Joel Wong, ilk virüsler potansiyel olarak kolibaktin
toksinlerin yaptığını düşündüğümüz bu bileşik ile hastalık arasında bir kez yan yana çalışmaya başladılar. üreticilerine fayda sağlayan komşu
hedef organizmaları doğrudan bağlantı kurmanın özellikle zor olduğu Konuşmaları onları ve Balskus'u bakterilerde ölüm yerine genetik
öldürmüyor. Bunun yerine, kolibaktin da kanıtlandı. kalabalık bir bağırsakta kolibaktinin değişikliklere neden olabilir.
mikrobiyal hücreleri bazı bakterilerin diğer mikropları nasıl etkilediğini
genomlarında saklanan gizli ve 2006'da bir Fransız ekip, bağırsak merak etmeye yöneltti. Balskus'un ekibinin keşifleri, kanserin,
ölümcül virüsleri aktive edecek şekilde bakterisi E. coli ile karşılaşan kolibaktin üreten bakterilerin yaptığı
ayarlıyor” dedi. memeli hücrelerinin DNA'larında Başlangıçta, kolibaktin üreten başka herhangi bir şeyin neden
ölümcül hasar gördüğünü bildirmişti. bakterileri üretici olmayanlara olduğu ikincil hasar olabileceğini
Colorado Üniversitesi Tıp Fakültesi'nde Araştırmacılar bu hasarı karmaşık bir maruz bırakmanın çok az etkisi düşündürmekte. Balskus, “Bakterilerin
bakteriyel virüsler üzerinde çalışan molekül oluşturmak için makineyi olduğunu buldular, bu da molekülün bu toksini bir şekilde diğer bakterileri
kodlayan bir E. coli gen kümesine kendi başına özellikle ölümcül hedef almak için ürettiğinden her
bağladılar. Kolibaktin olarak olmadığını düşündürdü. Silpe ve zaman şüphelendik. Evrimsel bir bakış
adlandırılan molekülü incelemek Wong, büyük ve kararsız bir molekül açısıyla olaya baktığımızda insan
olağanüstü derecede zordu. Birçok olan kolibaktinin DNA'larına zarar hücrelerini hedef almak için böyle
denemeden sonra araştırmacılar onu vermek için bakteri hücrelerine bir şeyi edinmeleri pek de mantıklı
E. coli'den izole edemediler. bile girip giremeyeceğinden emin değildi” dedi.
değildi. Üçüncü bir tarafın, yani
Kolibaktin, bilim insanlarının, bakteri bulaşan virüslerin, dahil olup İlerleyen zamanlarda Balskus, bileşiğin
mikropların ürettiğinden şüphelendiği olmadığını merak ettiler. Bu virüsler, bağırsaktaki mikrop topluluğunu nasıl
birçok geçici bileşikten biridir. genetik bilgi parçalarından pek de değiştirdiğini araştırmayı planlıyor.
Uzaydaki görünmez karanlık madde fazlası değiller, ancak bakterilerin Özellikle de hangilerinin bileşiğe
parçacıkları gibi, bu “kimyasal karanlık DNA'sına sızabilir ve sessizce pusuda maruz kaldıktan sonra kaybolduğunu
madde” üzerinde çalışmak için de bekleyebilirler. Ardından, bir kez ve hangilerinin geliştiğini görmek
Bazı bağırsak bakterileri, komşu yaratıcı araçlar gerekiyor. Balskus, tetiklendiklerinde, hücreyi bir mayın istiyor. “Kanseri önlemenin anahtarı,
mikropların genomlarında gizlenen, bağırsağın mikrobiyal kimyasını gibi havaya uçuran bir enfeksiyona kolibaktinin mikrop topluluğu
kolibaktin adı verilen bir molekül araştırmasının bir parçası olarak bu neden olurlar. üzerindeki etkilerini ve üretiminin
üretirler. Bu bakteriler içlerinde anlaşılması zor molekülleri incelemek nasıl kontrol edildiğini anlamak
ölümcül virüs barındıran diğer için dolaylı yaklaşımlar kullandı. Son Araştırmacılar, bu tür gizli virüsleri olabilir.”
bakterilerdeki bu virüsleri aktif hale 10 yılda ekibi, onu üreten mikrobiyal taşıyan bakterilerin yanında kolibaktin
getirirler (koyu kırmızı) Kaynak: makineleri inceleyerek kolibaktini üreticileri yetiştirdiklerinde, viral Makale: https://www.nature.com/
Illüstrasyon © Fairman Studios, LLC araştırdı. O ve meslektaşları, parçacıkların sayısının arttığını articles/s41586-022-04444-3m