Page 24 - BİOMEDYA SAYI 41
P. 24
24 BİYOTEKNOLOJİ VE YAŞAM BİLİMLERİ GAZETESİ KASIM - ARALIK 2022 www.biomedya.com
BILIM INSANLARI 30 YENI
DOĞAL BILEŞIK KEŞFETTI
Araştırmacılar, benzeri görülmemiş bir hız ve ölçekte yeni
ribozomal olarak sentezlenmiş ve translasyon sonrası modifiye
edilmiş peptitleri keşfedip karakterize edebildiler.
Modern tıp, bakterilerin doğal olarak Biyoüretim için Illinois Biyolojik edildi. Yüksek verimli teknoloji, olduğunu söylüyor: yüksek verimli
ürettiği ilaçları kapsamlı bir şekilde Dökümhanesini kullanan yeni RiPP'leri yaklaşık 400 genden oluşan 96 yolun teknolojinin yeni RiPP'ler için gen
kullanır. En dikkat çekici doğal benzeri görülmemiş bir hız ve ölçekte aynı anda test edilmesine izin verdi. kümelerini hızlı bir şekilde oluşturma
ürünlerden biri de bazı küflerden bulup karakterize edebildiler. ve test etme yeteneğini göstermek
elde edilen ve tıp ve insan sağlığı Shi, "Geleneksel RiPP keşif ve aynı zamanda mümkün kılınan
alanındaki en önemli gelişmelerden iBioFAB, aynı anda yüzlerce genden yöntemleriyle karşılaştırıldığında, büyük ölçekli ortak proje türlerini
biri olarak kabul edilen bir antibiyotik birçok sentetik gen yolunu analiz platformumuz biyosentetik gen vurgulamak. IGB içinde. Mitchell,
olan penisilindir. Bilim adamları artık edebilen ve oluşturabilen bir kümesi tanımlama, klonlama, üretim "Laboratuvarlarımızdan herhangi
yüz binlerce mikrobiyal genoma ve laboratuvar otomasyon sistemidir; ve tespit ve karakterizasyondan birinin tüm bunları kendi başına
DNA dizilimi daha ucuz ve hızlı hale bu, tipik olarak çok sayıda araştırmacı birçok açıdan ölçeklenebilir ve yüksek yapmasına imkan yok. IGB, bu tür
geldikçe yaptıkları doğal bileşiklere ve yapılması gereken çok daha fazla verimlidir. Bunun, büyük ölçekli RiPP disiplinler arası araştırmalar için pota
erişebiliyor. zaman gerektiren bir görevdir. Bu keşfi için bu türden ilk platform sağladı.”dedi.
çalışma, Mitchell'in laboratuvarı, olduğunu söyleyebilirim." dedi.
Bununla birlikte, Illinois Huimin Zhao'nun laboratuvarı (BSD/ Battiste, IGB'nin tasarımı sayesinde
Üniversitesi'nde John ve Margaret GSE lideri/CABBI/CGD/MMG), Steven Keşfedilen yeni bileşiklerden üçünün bunun gibi ortak projelere doğal
Witt Kimya Profesörü Doug Mitchell'e L. Miller Kimya ve Biyomoleküler antibakteriyel özelliklere sahip olarak nasıl ilham verdiğini anlattı.
(MMG) göre, bu organizmaların sahip Mühendisliği Başkanı ve Wilfred van olduğu bulundu. Son derece öldürücü Battiste, "IGB, temanızda onları her
oldukları genetik yolları kullanarak der Donk'un (MMG) laboratuvarı antibiyotiğe dirençli bakteriler olan zaman gördüğünüzde insanlarla
üretebildikleri bileşiklerin sayısıyla arasındaki bir ortaklıktır. Klebsiella pneumoniae'ye karşı konuşmayı çok kolaylaştırıyor, bu da
karşılaştırıldığında bu sayı önemsizdir. test edildiğinde, yeni keşfedilen onlarla proje başlatmanın önündeki
Üç ortak yazar, Alex Battiste, antibakteriyel RiPP'lerin tehlikeli engelleri azaltıyor. MMG temasındaki
Mitchell, "Bu, buzdağının sadece dördüncü sınıf Ph.D. Mitchell bakterileri öldürmede etkili herkes, farklı laboratuvarlardan olsak
görünen kısmı. Bugün bilinen laboratuvarında öğrenci olan olduğu bulundu. Araştırmacılar bile benzer şeyler üzerinde çalışıyor.
moleküller açısından bildiklerimiz ile Chengyou Shi, beşinci sınıf Ph.D. bunun, mevcut antibiyotik ilaçlara Yani hepimizin farklı uzmanlık türleri
doğanın üretme kapasitesine sahip Zhao laboratuvarındaki aday ve van dirençli bakterilere karşı etkili var ama bunlar birbirine çok iyi
olanlar arasında bir eşitsizlik var. En der Donk laboratuvarında postdoc bileşikleri keşfetmek için yeni bir yol uyuyor ve kullandıkları teknik türleri
azından bire 100 gibi.” dedi. olan Richard Ayikpoe, her birinin olabileceğini söylüyor. hakkında bilgi ediniyorsunuz. Burada
kendi laboratuvarlarında projenin çalışmanın en sevdiğim yanlarından
Ribozomal olarak üretilmiş ve post- bir bölümünü nasıl yönettiklerini Ayikpoe, "Klebsiella da dahil olmak biri, ekipteki tüm insanlar arasındaki
translasyonel olarak modifiye edilmiş anlattı. Shi'nin ekibi sentetik genleri üzere hastane kaynaklı enfeksiyonlara dostluk duygusu.” dedi.
peptitler veya kısaca "RiPP'ler", sipariş etti ve ardından RODEO adlı karıştığı bilinen patojenlere karşı
popüler bir antibiyotik kaynağı haline bir genom madenciliği programıyla antimikrobiyal özelliklere sahip üç İlk ortak yazarların üçü de IGB'yi
gelen bir tür doğal üründür. RiPP'lere entegre iBioFAB kullanarak bunları RiPP bulduk. Bu araştırma, bir kerede araştırma yapmak için harika bir
erişim için geleneksel yaklaşımlar aday yollara veya gen kümelerine tarayabileceğimiz biyosentetik gen yer yapanın hem insanlar hem de
zahmetlidir ve hangi bileşiği ürettiğini birleştirdi. Ardından, hangi yolların kümelerinin sayısını artırmak için teknoloji olduğunu vurgulayarak,
gözlemlemek için her genin E. coli işlevsel olduğunu ve E. coli'de yeni bu platformu kullanarak, terapötik eğitim, araştırma ve iş beklentilerinin
gibi bir model organizmaya teker RiPP'ler üretme olasılığını test etmek özelliklere sahip olabilecek anti- IGB'de geçirdikleri zamandan nasıl
teker eklenmesini içerir. Bununla için Battiste ve Ayikpoe'nun ekiplerine mikrobiyal bileşikleri keşfetme büyük fayda sağladığını anlattı.
birlikte araştırmacılar, Carl R. Woese farklı gen küme sınıfları verildi. olasılığımızın daha yüksek olduğunu Ayikpoe, "IGB'nin hem bilim hem de
Genomik Biyoloji Enstitüsü'ndeki Antibiyotik aktivite gösteren RiPP'lerin gösteriyor." dedi. sosyal yaşam açısından çeşitlilik ve
büyük bir ortak çabanın sonucu olan tüm yapıları, Ayikpoe'nun ekibi büyümede sunduğu işbirlikçi atmosfer
yakın tarihli bir çalışmada, Gelişmiş tarafından ayrıntılı olarak karakterize Ekip, makalenin amacının iki yönlü gerçekten dikkat çekici" dedi.