Page 24 - BİOMEDYA SAYI 41
P. 24

24                    BİYOTEKNOLOJİ VE YAŞAM BİLİMLERİ GAZETESİ  KASIM - ARALIK          2022       www.biomedya.com
































         BILIM INSANLARI 30 YENI

         DOĞAL BILEŞIK KEŞFETTI




                Araştırmacılar, benzeri görülmemiş bir hız ve ölçekte yeni
                ribozomal olarak sentezlenmiş ve translasyon sonrası modifiye
                edilmiş peptitleri keşfedip karakterize edebildiler.




        Modern tıp, bakterilerin doğal olarak   Biyoüretim için Illinois Biyolojik   edildi. Yüksek verimli teknoloji,   olduğunu söylüyor: yüksek verimli
        ürettiği ilaçları kapsamlı bir şekilde   Dökümhanesini kullanan yeni RiPP'leri   yaklaşık 400 genden oluşan 96 yolun   teknolojinin yeni RiPP'ler için gen
        kullanır. En dikkat çekici doğal   benzeri görülmemiş bir hız ve ölçekte   aynı anda test edilmesine izin verdi.  kümelerini hızlı bir şekilde oluşturma
        ürünlerden biri de bazı küflerden   bulup karakterize edebildiler.                               ve test etme yeteneğini göstermek
        elde edilen ve tıp ve insan sağlığı                              Shi, "Geleneksel RiPP keşif     ve aynı zamanda mümkün kılınan
        alanındaki en önemli gelişmelerden   iBioFAB, aynı anda yüzlerce genden   yöntemleriyle karşılaştırıldığında,   büyük ölçekli ortak proje türlerini
        biri olarak kabul edilen bir antibiyotik   birçok sentetik gen yolunu analiz   platformumuz biyosentetik gen   vurgulamak. IGB içinde. Mitchell,
        olan penisilindir. Bilim adamları artık   edebilen ve oluşturabilen bir   kümesi tanımlama, klonlama, üretim   "Laboratuvarlarımızdan herhangi
        yüz binlerce mikrobiyal genoma ve   laboratuvar otomasyon sistemidir;   ve tespit ve karakterizasyondan   birinin tüm bunları kendi başına
        DNA dizilimi daha ucuz ve hızlı hale   bu, tipik olarak çok sayıda araştırmacı   birçok açıdan ölçeklenebilir ve yüksek   yapmasına imkan yok. IGB, bu tür
        geldikçe yaptıkları doğal bileşiklere   ve yapılması gereken çok daha fazla   verimlidir. Bunun, büyük ölçekli RiPP   disiplinler arası araştırmalar için pota
        erişebiliyor.                    zaman gerektiren bir görevdir. Bu   keşfi için bu türden ilk platform   sağladı.”dedi.
                                         çalışma, Mitchell'in laboratuvarı,   olduğunu söyleyebilirim." dedi.
        Bununla birlikte, Illinois       Huimin Zhao'nun laboratuvarı (BSD/                              Battiste, IGB'nin tasarımı sayesinde
        Üniversitesi'nde John ve Margaret   GSE lideri/CABBI/CGD/MMG), Steven   Keşfedilen yeni bileşiklerden üçünün   bunun gibi ortak projelere doğal
        Witt Kimya Profesörü Doug Mitchell'e   L. Miller Kimya ve Biyomoleküler   antibakteriyel özelliklere sahip   olarak nasıl ilham verdiğini anlattı.
        (MMG) göre, bu organizmaların sahip   Mühendisliği Başkanı ve Wilfred van   olduğu bulundu. Son derece öldürücü   Battiste, "IGB, temanızda onları her
        oldukları genetik yolları kullanarak   der Donk'un (MMG) laboratuvarı   antibiyotiğe dirençli bakteriler olan   zaman gördüğünüzde insanlarla
        üretebildikleri bileşiklerin sayısıyla   arasındaki bir ortaklıktır.  Klebsiella pneumoniae'ye karşı   konuşmayı çok kolaylaştırıyor, bu da
        karşılaştırıldığında bu sayı önemsizdir.                         test edildiğinde, yeni keşfedilen   onlarla proje başlatmanın önündeki
                                         Üç ortak yazar, Alex Battiste,   antibakteriyel RiPP'lerin tehlikeli   engelleri azaltıyor. MMG temasındaki
        Mitchell, "Bu, buzdağının sadece   dördüncü sınıf Ph.D. Mitchell   bakterileri öldürmede etkili   herkes, farklı laboratuvarlardan olsak
        görünen kısmı. Bugün bilinen     laboratuvarında öğrenci olan    olduğu bulundu. Araştırmacılar   bile benzer şeyler üzerinde çalışıyor.
        moleküller açısından bildiklerimiz ile   Chengyou Shi, beşinci sınıf Ph.D.   bunun, mevcut antibiyotik ilaçlara   Yani hepimizin farklı uzmanlık türleri
        doğanın üretme kapasitesine sahip   Zhao laboratuvarındaki aday ve van   dirençli bakterilere karşı etkili   var ama bunlar birbirine çok iyi
        olanlar arasında bir eşitsizlik var. En   der Donk laboratuvarında postdoc   bileşikleri keşfetmek için yeni bir yol   uyuyor ve kullandıkları teknik türleri
        azından bire 100 gibi.” dedi.    olan Richard Ayikpoe, her birinin   olabileceğini söylüyor.     hakkında bilgi ediniyorsunuz. Burada
                                         kendi laboratuvarlarında projenin                               çalışmanın en sevdiğim yanlarından
        Ribozomal olarak üretilmiş ve post-  bir bölümünü nasıl yönettiklerini   Ayikpoe, "Klebsiella da dahil olmak   biri, ekipteki tüm insanlar arasındaki
        translasyonel olarak modifiye edilmiş   anlattı. Shi'nin ekibi sentetik genleri   üzere hastane kaynaklı enfeksiyonlara   dostluk duygusu.” dedi.
        peptitler veya kısaca "RiPP'ler",   sipariş etti ve ardından RODEO adlı   karıştığı bilinen patojenlere karşı
        popüler bir antibiyotik kaynağı haline   bir genom madenciliği programıyla   antimikrobiyal özelliklere sahip üç   İlk ortak yazarların üçü de IGB'yi
        gelen bir tür doğal üründür. RiPP'lere   entegre iBioFAB kullanarak bunları   RiPP bulduk. Bu araştırma, bir kerede   araştırma yapmak için harika bir
        erişim için geleneksel yaklaşımlar   aday yollara veya gen kümelerine   tarayabileceğimiz biyosentetik gen   yer yapanın hem insanlar hem de
        zahmetlidir ve hangi bileşiği ürettiğini   birleştirdi. Ardından, hangi yolların   kümelerinin sayısını artırmak için   teknoloji olduğunu vurgulayarak,
        gözlemlemek için her genin E. coli   işlevsel olduğunu ve E. coli'de yeni   bu platformu kullanarak, terapötik   eğitim, araştırma ve iş beklentilerinin
        gibi bir model organizmaya teker   RiPP'ler üretme olasılığını test etmek   özelliklere sahip olabilecek anti-  IGB'de geçirdikleri zamandan nasıl
        teker eklenmesini içerir. Bununla   için Battiste ve Ayikpoe'nun ekiplerine   mikrobiyal bileşikleri keşfetme   büyük fayda sağladığını anlattı.
        birlikte araştırmacılar, Carl R. Woese   farklı gen küme sınıfları verildi.   olasılığımızın daha yüksek olduğunu   Ayikpoe, "IGB'nin hem bilim hem de
        Genomik Biyoloji Enstitüsü'ndeki   Antibiyotik aktivite gösteren RiPP'lerin   gösteriyor." dedi.  sosyal yaşam açısından çeşitlilik ve
        büyük bir ortak çabanın sonucu olan   tüm yapıları, Ayikpoe'nun ekibi                            büyümede sunduğu işbirlikçi atmosfer
        yakın tarihli bir çalışmada, Gelişmiş   tarafından ayrıntılı olarak karakterize   Ekip, makalenin amacının iki yönlü   gerçekten dikkat çekici" dedi.
   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28