Page 5 - BİOMEDYA SAYI 07
P. 5

www.biomedya.com
        NANOPARTIKÜLLER


        PZR NEDIR?




        Elçin Ekşi


        Pek çok polimeraz zincir reaksiyonu   Nanopartikül PZR nedir?   özelliklerden biri ise yüzey alanını   konsantrasyonda partikül eklemenin
        (PZR) metodu var ve araştırma   Nanopartiküller aracılığı ile PZR’nin   çok ciddi oranda arttırmasıdır. PZR   hassasiyeti arttırdığını ortaya
        ihtiyaçlarına göre uygun metodu   güçlendirilmesi ve hassasiyetinin   uygulamalarında ise quantum dot   çıkarmışlardır. 0.7-13 nM altın
        seçip kullanıyoruz. Son dönemde   arttırılmasına nanopartikül PZR   teknolojisi, nanotüpler, çok duvarlı   nanopartikül ile 10 ila 1000 kat
        ise nanoteknoloji araştırmalarının   denmektedir. Nanopartiküller   nanotüpler, altın nanopartiküller gibi   hassasiyet artışı sağlamışlardır.
        hızlanması ve artmasıyla PZR’de   1-100 nm boyutu arasında bulunan   pek çok materyal denenmiş ve yeni   Yaptıkları çalışmada bunun en önemli
        nanoteknolojinin faydalarından   partiküllere verilen genel bir isimdir.   yöntemler geliştirilmiştir.   sebebinin altın nanopartiküllerin
        yararlanmaya başladı. Yeni geliştirilen   Nanopartiküller pek çok alanda                       üstün ısı transferi sağladığını ve bu
        PZR yöntemleri nanopartiküllerle   kullanılmakta olup bunlardan biri   2005 yılında Min Li ve ekibi PZR   şekilde verimliliği arttırdığını öne
        destekleniyor. Pek çok farklı   de yaşam bilimleridir. Nanometro   etkinliğini altın naopartiküllerle   sürmüşlerdir .  Bu çalışmaların
                                                                                                                 (1)
        nanopartikül destekli PZR yöntemi   boyutunda ama çok sayıda olan   arttırmayı denemişlerdir. Yaptıkları   devamında Ma X ve ekibi 2013 yılında
        geliştirilmiş durumda.          bu partiküllerin sağladığı bir önemli   çalışma sonucunda nanomolar   virüs tespiti için nanopartikül ile
                                                                                                       geliştirilmiş bir PZR kiti geliştirmişlerdir
                                                                                                       (2) .

                                                                                                       Benzer pek çok çalışma ile PZR
                                                                                                       hassasiyetini arttıran çalışma
                                                                                                       bulunmaktadır. Ancak mekanizmanın
                                                                                                       tam olarak nasıl çalıştığı net olarak
                                                                                                       henüz ortaya çıkarılmamıştır.
                                                                                                       Nanopartiküllerin PZR ektinliğini bu
                                                                                                       derece arttırıyor olmasını açıklamak
                                                                                                       için beş farklı teori bulunmaktadır.
                                                                                                       Bunlardan ilki partiküllerin polimeraz
                                                                                                       enzimlerinin bir kısmını absorbladığı ve
                                                                                                       polimerazların daha uzun süre etkinlik
                                                                                                       gösterebildiği yönündeyken diğer
                                                                                                       bir teori, nanopartiküllerin primerleri
                                                                                                       absorbladığı ve böylece daha etkin
                                                                                                       uzama sağladığı yönünde. Üçüncü
                                                                                                       bir yaklaşım ise nanopartiküllerin
                                                                                                       oluşan PZR ürünlerini absorbe ettiği
                                                                                                       ve zincirler birbirlerinden ayrılırken
                                                                                                       daha kontrollü bir ayrılma sağlandığı
                                                                                                       yönünde. Dördüncü yaklaşım Li ve
                                                                                                       ekibinin yaklaşımı olan ısı transferinin
                                                                                                       daha etkin olması ve böylece PZR
                                                                                                       etkinliğinin artması şeklinde olurken
                                                                                                       beşinci teori ise nanopartiküllerin
                                                                                                       aslında PZR üzerinde fazla bir etkinliği
                                                                                                       olmadığı ama uzun PZR ürünlerini
                                                                                                       baskılayıp, kısa olan PZR ürünlerinin
                                                                                                       seçilimini sağladığı yönünde.

                                                                                                       Laboratuvarda günlük hayatımızın bir
                                                                                                       parçası olan PZR’nin nanoteknoloji ile
                                                                                                       buluşması, ileride daha az malzemeyle
                                                                                                       daha kısa sürede daha iyi sonuçlar
                                                                                                       alabileceğimize işaret etmekte.

                                                                                                       Kaynak:
                                                                                                       1- Li M,  Y Lin, C Wu, and H Liu. (2005) Enhancing
                                                                                                       the Efficiency of a PCR Using Gold Nanoparticles.
                                                                                                       Nucleic Acids Research. 33: e184. doi:10.1093/
                                                                                                       nar/gni183. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/
                                                                                                       articles/PMC1297711/pdf/gni183.pdf
                                                                                                       2- Ma X, et.al. (2013) A Nanoparticle-Assisted
                                                                                                       PCR Assay to Improve the Sensitivity for Rapid
                                                                                                       Detection and Differentiation of Wild-Type
                                                                                                       Pseudorabies Virus and Gene-Deleted Vaccine
                                                                                                       Strains.  Journal of Virological Methods. 193:
                                                                                                       374–78. doi:10.1016/j.jviromet.2013.07.018.
   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10