Page 17 - BİOMEDYA SAYI 38

17
www.biomedya.com MAYIS - HAZİRAN 2022 BİYOTEKNOLOJİ VE YAŞAM BİLİMLERİ GAZETESİ

değil, daha çok ucu bucağı olmayan yeni kafadanbacaklı gen ailelerinde RNA DÜZENLEME alındığında, çalışma için seçilmiştir.
genomların yeniden düzenlemeleri, diğer hayvanlarda ortak olan bazı eski
sanki ataların genomları bir gen düzenleri korunurken genlerin MBL'deki önceki araştırmalar, Albertin, "Genomunu sıralayarak bir
karıştırıcıya konmuş gibi" dedi. düzenlenmesi çok farklı görünüyor. kalamarların ve ahtapotların, hayvan hakkında çok şey öğrenebiliriz
Bu kafadanbacaklılara özgü gen hayvanların üretebileceği protein ve genom, ileriye dönük her türlü
Bu yeni bilgiyle kafadanbacaklıların ailelerinden bazıları, kalamar beyni türlerini çeşitlendiren olağanüstü araştırma için önemli bir araç seti
ve omurgalıların paylaştığı bu temel de dahil olmak üzere, benzersiz yüksek bir RNA düzenleme oranı sağlar" açıklamasında bulundu.
benzersiz özelliklerin, özellikle kafadanbacaklı özelliklerinde yüksek sergilediğini göstermiştir. Bu
orantısız olan büyük beyinlere oranda ifade edilmektedir. bulguyu takip etmek için Albertin, BUNLAR:
ve büyük bedenler sahip olma Doryteuthis'te 26 farklı dokudan RNA'yı
kapasitelerinin altında, büyük BAZI GEN AILELERI ALIŞILMADIK sıraladı ve farklı dokular arasında RNA Atlantik’te yaşayan uzun yüzgeçli
ölçekli genom değişikliklerinin nasıl ŞEKILDE GENIŞLER düzenleme oranlarına baktı. kıyı kalamarı (Doryteuthis pealeii).
olabileceği sorulmaya başlanabilir. MBL'de ve başka yerlerde bu kalamar
Şaşırtıcı bir şekilde üç kafadanbacaklı Albertin yaptığı açıklamada, Albertin, "Bir proteinin dizisini sinir üzerinde yaklaşık bir yüzyıla yakın
genomunun, diğer hayvanlarla "Bunun heyecan verici bir örneği sistemiyle, özellikle beyinde ve dev süren araştırma nörotransmisyonun
temel ilkelerini ortaya çıkardı (bazı
keşifler Nobel Ödülü de kazandı).
Yine de üzerinde iyi çalışılmış bu
kalamar hakkında çıkarılan genom
dizisinin ilk raporudur. İki yıl önce, bir
MBL ekibi, ön genomik dizi verileri ve
CRISPr-Cas9 genom düzenlemesinden
KAFADANBACAKLILARIN yararlanarak Doryteuthis pealeii
kullanarak bir kafadanbacaklıda ilk
gen nakavtını gerçekleştirdi.
GENOMLARI ÜZERINDE YENI ÇALIŞMALAR Hawaii kısa kuyruklu mürekkep balığı

(Euprymna scolopes). Parlayan bir
bakteri, kalamardaki benzersiz bir
"hafif organın" içinde, her ikisinin de
karşılıklı yararına yaşar (simbiyotik
ilişki). Bu tür, hayvan-bakteriyel
simbiyoz ve gelişimin diğer yönlerini
incelemek için bir model sistem haline
geldi. 2019'da bir taslak E. scolopes
genom derlemesi yayınlandı.

Kaliforniya iki benekli ahtapotu
(Octopus bimaculoides). Bilimsel
araştırma bloğunda nispeten yeni
olan tür, şimdiye kadar dizilenen ilk
ahtapot genomuydu. Albertin, 2015
yılında taslak genomunu yayınlayan
ekibin ortak liderliğini yaptı.

MAKALELER:

“Genome and Transcriptome
Mechanisms Driving Cephalopod
Evolution” by Caroline B. Albertin,
Atlantik’te bulunan uzun yüzgeçli kıyı kalamarı Doryteuthis pealeii, bilim insanları tarafından sinirbilim araştırmaları için bir Sofia Medina-Ruiz, Therese Mitros,
model sistem olarak yaklaşık bir yüzyıldır incelenmiştir. Kaynak: Elaine Bearer Hannah Schmidbaur, Gustavo Sanchez,
Z. Yan Wang, Jane Grimwood, Joshua J.
karşılaştırıldığında, birbirlerine göre de protokadherin genleridir. fiber lobunda sınırlandıracak şekilde C. Rosenthal, Clifton W. Ragsdale, Oleg
oldukça yeniden düzenlenmiş olduğu Kafadanbacaklılar ve omurgalılar değiştiren RNA düzenlemesi için Simakov and Daniel S. Rokhsar, 4 May
da bulundu. zamanla bu gen ailesini kaybeden çok güçlü bir sinyal bulduk. Farklı 2022, Nature Communications.
sinekler ve nematodların aksine, dokular arasındaki bu kurgu kataloğu,
Albertin, "Ahtapot ve kalamar yaklaşık protokadherinlerini bağımsız olarak kurgunun etkileri hakkında takip DOI: 10.1038/s41467-022-29748-w
300 milyon yıl önce birbirlerinden kopyaladılar. Bu kopyalama, belki de eden sorular sormak için bir kaynak
ayrıldılar. Bu yüzden çok ayrı evrimsel omurgalılarda ve kafadanbacaklılarda sağlıyor. Örneğin, RNA düzenlemesi, “Emergence of novel cephalopod gene
geçmişleri varmış gibi görünüyorlar. Bu büyük ve karmaşık sinir sistemlerinin hayvanın sıcaklıktaki veya diğer regulation and expression through
heyecan verici sonuç, kafadanbacaklı bağımsız evriminde rol oynayan çevresel faktörlerdeki değişikliklere large-scale genome reorganization”
genomlarındaki dramatik yeniden zengin bir moleküler çerçeveyle uyum sağlamasına yardımcı olmak için by Hannah Schmidbaur, Akane
düzenlemelerin, kalamar ve ahtapot sonuçlandı. Ayrıca, kalamarın mi gerçekleşiyor? Genom dizilerinin Kawaguchi, Tereza Clarence, Xiao Fu,
evriminde önemli olan yeni gen gaga taşını (kalamar kemiği) veya yanı sıra, RNA düzenleme sitelerinin Oi Pui Hoang, Bob Zimmermann, Elena
düzenleri ürettiğini gösteriyor" emicilerini yapmakla ilgili genler gibi ve oranlarının kataloğuna sahip A. Ritschard, Anton Weissenbacher,
açıklamasında bulundu. türe özgü gen ailesi genişlemelerini olmak, gelecekteki çalışmaları büyük Jamie S. Foster, Spencer V. Nyholm,
de buldular. Bu gen ailelerinin hiçbiri ölçüde kolaylaştıracaktır" dedi. Paul A. Bates, Caroline B. Albertin, Elly
YENI GEN AILELERI IÇERIYORLAR ahtapotta bulunamadı. Bu yüzden, bu Tanaka and Oleg Simakov, 21 April
ayrı hayvan grupları, yeni biyolojilerini Bu üç kafadanbacaklı türü, bilimsel 2022, Nature Communications.
Ekip, kafadanbacaklılara özgü yeni gen gerçekleştirmek için yeni gen aileleri araştırmalara geçmişteki ve
ailelerinde yüzlerce gen tanımladı. Bu ile geliyorlar" dedi. gelecekteki önemleri göz önüne DOI: 10.1038/s41467-022-29694-7