Biyoteknoloji / Çevre ve Endüstri
Adli DNA çalışmaları, tehlike altındaki türlerin korunmasına yardımcı olabilir.
Pürtüklü semender (Triturus cristatus) 1940larda habitat kaybından dolayı sayısı azalan, Kuzey Avrupa ve Asya’nın bazı kısımlarında bulunan bir amfibi olup, İngiltere’de iyi bilinen korunan türlerdendir.
Her türün kendine özel yaşam alanını ve bazı alanlarda ek yasal koruma ihtiyacı olup olmadığını nasıl izleyebiliriz? Önceleri, türlerin tespiti, aylar süren şişe ve tuzak setleri kullanılarak yumurta avı ile ve bir sürü hataya açık gece iz sürme şeklindeydi.
Bu nedenle, 2013 yılında İngiltere Çevre ve Kırsal İşler Bakanlığı (DEFRA), Doğal İngiltere, Ortak Doğa Koruma Komitesi ve İşkoç Doğal Mirası tarafından finanse edilen yeni bir yöntem olan eDNA (environmental DNA) ile tür tespiti yapılmaya başlandı. 
Biyoçeşitlilik CSI/olay yeri incelemesi olarak tanımlanan eDNA, (çevresel DNA) hayvanlar tarafından suya bırakılan deri, dışkı, mukus, kıl, yumurta ve spermlerdeki genetik materyaldir. Bu teknik ile DNA’nın varlığını ölçmek ve semender DNA’sının izlerini sürmek için tek ihtiyacınız olan havuz suyu örneği olmaktadır. Yeterli su örneğinin doğru muamelesi ile bu örnek içerisinde çevreden gelen biyolojik partiküllerdeki DNA’yı izole edebilirsiniz.
Spygen, 2011 yılında Laboratoire d’Ecologie Alpine (LECA), the CNRS at the Université Grenoble and the Université Savoie Mont Blanc.’dan ayrılan, moleküler ekoloji konusunda uzmanlaşmış bir biyoteknoloji oluşumudur.
Bu İngiltere projesi, Amphibian and Reptile Conservation, Durrell Institute of Conservation ve Ecology at the University of Kent işbirliğinde Spygen’in eDNA araçları kullanılarak Freshwater Habitats Trust tarafından gerçekleştirilmiş. eDNA örnekleri Kopenhag’da bulunan Danimarka Doğa Tarihi Müzesinde GeoGenetics merkezindeki takım tarafından tasarlanan primerler ve problar kullanılarak analiz edilmiş.
Araştırma sırasında, in siliko analizler ilk olarak ecoPCR yazılımı ile çalışılmış, primer taslağı analizleri EMBL-Bank, 56 Avrupa amfibi türünü içeren SPYGEN referans veri tabanı ile karşılaştırılmıştır.Primerler ve problar, üç farklı popülasyondan dış sürüntü yolu ile 16 büyük pürtüklü semenderden toplanan doku örnekleri in vitro olarak test edilmiştir. Qiagen’in Yeni Nesil Sekanslama birimi (Almanya) tarafından geliştirilen DNA kan ve doku kiti kullanılarak DNA elde edilmiştir. eDNA metodu geleneksel yönteme göre pürtüklü semender varlığını tespit etmede daha etkili bulunmuştur. Aynı zamanda bu yöntem daha kolay, cerrahi işlem gerektirmeyen ve daha ucuz bir alternatiftir. Böylece doğadaki semender popülasyonu da bu çalışmadan doğrudan etkilenmemiştir.
Bu moleküler biyoçeşitlilik aracı, semenderler için olduğu kadar, işletmeler ve kendi arazilerinde bulunan türleri izlemek isteyen toprak sahipleri için de faydalı bir yöntem olarak ön plana çıkmaktadır. Ayrıca pek çok çevresel izleme programı için doğal popülasyonlara zarar vermeden takibi mümkün kılabilmektedir.
Bir kez daha teşekkürler Biyoteknoloji...
http://labiotech.eu/how-forensic-edna-help-conserve-endangered-species-spygen/
