Biomedya - Biyoteknoloji & Yaşam Bilimleri

Uluslararası bir araştırma ekibi tarafından Nature Communications'da yayınlanan yeni bir araştırma, COVID-19'dan muzdarip insanların vücudun farklı bölgelerinde bağışıklık sisteminden gizlenmiş birkaç farklı SARS-CoV-2 varyantına sahip olabilir. Çalışmanın yazarları, bunun virüsün bulaşmış bir kişinin vücudundan kendi antikorları veya terapötik antikor tedavileri yoluyla tamamen temizlenmesini çok daha zor hale getirebileceğini söylüyor. 

COVID-19, hastaneye yatışlara ve ölümlere neden olarak dünyayı kasıp kavurmaya, dünya çapında topluluklara ve ekonomilere zarar vermeye devam ediyor. Ardışık endişe türleri (VoC), Wuhan'dan gelen orijinal virüsün yerini aldı ve aşı veya antikor tedavilerinin sunduğu bağışıklık korumasından giderek daha fazla kaçtı.

Nature Communications'da paralel olarak yayınlanan iki çalışmayı içeren yeni araştırmada, Bristol Üniversitesi'nden Profesör Imre Berger ve Heidelberg'deki Max Planck Tıbbi Araştırma Enstitüsü'nden Profesör Joachim Spatz tarafından yönetilen uluslararası bir ekip, her ikisi de Max Planck Bristol Merkezi'nin direktörleri Minimal Biyoloji, virüsün farklı hücre tiplerinde nasıl belirgin bir şekilde evrimleşebileceğini ve aynı enfekte konakta bağışıklığını nasıl adapte edebileceğini gösterir.

Bristol'de keşfedilen erken bir SARS-CoV-2 varyantı olan BrisDelta'dan sivri protein yapısı. Kredi: Christine Toelzer, Bristol Üniversitesi

Ekip, virüsün enfeksiyon döngüsünde SARS-CoV-2 spike proteinindeki kişiye özel bir cebin işlevini araştırmaya çalıştı. Bristol ekibi tarafından daha önceki bir buluşta keşfedilen cep, viral enfeksiyonda önemli bir rol oynadı.

Profesör Imre Berger, “Sürekli bir dizi varyant, dünya çapında hâkim olan Omicron ve Omicron 2 ile şimdiye kadar orijinal virüsün yerini aldı. Bristol, BrisDelta'da keşfedilen erken bir varyantı analiz ettik. Orijinal virüsten şeklini değiştirmişti, ancak keşfettiğimiz cep oradaydı, değişmeden."dedi. Şaşırtıcı bir şekilde, BrisDelta hastalardan alınan örneklerde küçük bir alt popülasyon olarak ortaya çıkıyor, ancak bazı hücre tiplerini ilk enfeksiyon dalgasına hâkim olan virüsten daha iyi enfekte ediyor gibi görünüyor.

BrisDelta çalışmasının baş yazarı Dr. Kapil Gupta şöyle açıkladı; “Sonuçlarımız, kişinin vücudunda birkaç farklı virüs varyantına sahip olabileceğini gösterdi. Bu varyantlardan bazıları, vücut baskın virüs tipine karşı savunma yapmakla meşgulken, saklanmak için nişleri olarak böbrek veya dalak hücrelerini kullanabilir. Bu, enfekte hastaların SARS-CoV-2'den tamamen kurtulmasını zorlaştırabilir."

Ekip, işteki viral mekanizmaları deşifre etmek için son teknoloji sentetik biyoloji teknikleri, son teknoloji görüntüleme ve bulut bilişim uyguladı. Cebin işlevini anlamak için bilim adamları, test tüpünde virüsü taklit eden, ancak insan hücrelerinde çoğalmadıkları için güvenli oldukları için büyük bir avantaja sahip olan sentetik SARS-CoV-2 virionları oluşturdular. 

Bu yapay viryonları kullanarak, viral enfeksiyonda cebin tam mekanizmasını inceleyebildiler. Bir yağ asidinin bağlanması üzerine, viryonları süsleyen başak proteininin şeklini değiştirdiğini gösterdiler. Bu ‘şekil’ değiştirme mekanizması, virüsü bağışıklık sisteminden etkili bir şekilde gizler.

Bu çalışmanın baş yazarı ve Heidelberg'deki Max Planck Enstitüsü ile Bristol'deki Max Planck Merkezi'nin ortak üyesi olan Dr. Oskar Staufer; “Bağışıklık sistemi tarafından daha az görünür. Bu, konakçı tarafından tespit edilmesini ve daha uzun bir süre için güçlü bir bağışıklık tepkisini önlemek ve toplam enfeksiyon verimliliğini artırmak için bir mekanizma olabilir.”dedi.

Yazarlar tarafından kurulan Bristol Üniversitesi'nden yeni çıkan Halo Therapeutics’den Profesör Berger;"Görünüşe göre bu yağ asitlerini tanımak için özel olarak oluşturulmuş bu cep, SARS-CoV-2'ye enfekte kişilerin vücudunda bir avantaj sağlayarak çok hızlı çoğalmasına izin veriyor. Bu, Omicron dahil tüm varyantlarda neden orada olduğunu açıklayabilir. İlginç bir şekilde, aynı özellik bize virüsü yenmek için eşsiz bir fırsat da sağlıyor, çünkü tam olarak çok korunmuş cebi bloke eden özel bir antiviral molekül ile cebe bağlanan pan-koronavirüs antiviralleri geliştirmek için tam olarak bu yaklaşımı takip ediyor.”dedi.

Makale:nature.com,nature.com, science.org