Bilim
Bakterilerin Hücresiz Odacıkları pH 5,1’e Kadar Asitleşiyor
Araştırmacılar canlı Caulobacter crescentus hücrelerinde oran ölçümlü floresan pH probları kullandı. Yoğun fazın pH’sı yaklaşık 5,1 ölçülürken çevredeki sitoplazma nötre yakındı. Tek molekül lokalizasyon mikroskopisi ve floresans yaşam süresi görüntüleme, RNase E içeren nanoskopik kümelerin hem mekânsal olarak değişken hem de asidik olduğunu ortaya koydu.
Sonuç, biyomoleküler kondensatların içinin homojen bir damlacık gibi davranmadığını gösteriyor. Aynı cisimciğin farklı bölgelerinde yoğunluk ve kimyasal koşullar değişebiliyor. Bu çeşitlilik, bakterilerin stres altında RNA işleme ve yıkım tepkilerini aynı yapının içinde farklı hızlarda yürütmesine yardımcı olabilir.
Araştırmacılar C-SNARF-4F ve RNase E CTD-pHluorin2 gibi problarla hücre dışı deneyler de yaptı. Tampon konsantrasyonu arttıkça gözlenen pH gradyanları zayıfladı; bu, kondensatın asitliğinin yük, difüzyon ve tamponlama dengesinden kaynaklandığını destekledi. Asidik ortamın RNA yıkımında görevli PNPase enziminin etkinliğini artırması, pH’nın yalnız bir özellik değil, işlevsel bir düzenleyici olduğunu gösterdi.
Çalışma belirli bir bakteri türü ve kondensat sistemiyle sınırlı. Prob davranışı, yerel iyon gücü ve floresans kalibrasyonu nanoskopik pH ölçümlerini etkileyebilir. Bulguların diğer bakterilerde ve ökaryotik kondensatlarda doğrulanması gerekiyor. Yine de pH’ye duyarlı ilaçların veya sentetik kondensatların tasarlanması için yeni bir biyoteknolojik ilke sunuyor.
