Genetik
Detaylı DNA Onarımı Görselleştirmesine Yeni Yaklaşım
Ulusal Kanser Araştırma Merkezi (CNIO) ve Massachusetts Genel Hastanesi’nden araştırmacılar, "Genetik hasarın onarımı, kromatin bağlamında koordine edilir, bu nedenle hücreler, DNA hasar yanıtı (DDR) faktörlerinin işe alınması için DNA kırılmalarında erişilebilirliği dinamik olarak modüle eder. DDR'de rolleri olan kromatin faktörlerinin tanımlanması, DNA onarımını incelemek için sağlam, yüksek verimli sistemlerden yoksunken, çoğunlukla işlev kaybı ekranlarına dayanıyordu. Bu çalışmada, DNA onarım kinetiğinin çalışılmasına ve faktörlerin 384 kuyulu bir plaka formatında çift iplik kopmalarına alınmasına izin veren iki yüksek verimli sistem geliştirdik." dedi.
CNIO'nun metabolizma ve hücre grubunun bir üyesi olan araştırmacı Barbara Martínez, DNA çift sarmal kopması gibi DNA hasarı olduğu anda, hücre ‘acil servisleri aramak’ gibi davranan DNA hasar yanıtı adlı bir mekanizmayı etkinleştirir. Martnez; "DNA lezyonlarının nasıl oluştuğunu ve nasıl onarıldığını öğrenerek, kanserin nasıl geliştiğini ve onunla nasıl savaşabileceğimizi öğreneceğiz. DNA onarımındaki herhangi bir yeni keşif, sağlıklı hücrelerimizi korurken daha iyi kanser tedavileri geliştirmeye yardımcı olacaktır.” dedi.
CNIO Confocal Unit tarafından tasarlanan bir makine öğrenimi analiz yönteminin yardımıyla, araştırmacılar, genetik hasarın indüklenmesinden sonra binlerce hücre resmini gözlemlemelerine izin veren yüksek verimli mikroskop kullandılar. İlk aşamada hücrelere 300'den fazla farklı protein soktular ve zamanla DNA onarımına müdahale edip etmediklerini tek bir deneyde değerlendirdiler. Bu tekniği kullanmak, DNA onarımında yer alan dokuz yeni proteini keşfetmelerini sağladı.
Yeni yaklaşım, araştırmacıların DNA onarımını incelemesine ve onu manipüle etmesine izin veriyor. Sözlerine devam eden Martinez; "Bir avantaj, her iki platformun da çok yönlü olması ve DNA onarımını etkileyen yeni genleri veya kimyasal bileşikleri keşfetmek için kullanılabilmesidir. DNA onarımının doğrudan görselleştirilmesine izin veren teknikleri kullanarak yüzlerce proteini minimum sürede değerlendirdik." şeklinde aktardı.
